108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18239 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18239  predicted protein  100 
 
 
1058 aa  2188    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47051  predicted protein  36.4 
 
 
1007 aa  558  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00853126  hitchhiker  0.000628668 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02310  transcriptional elongation regulator, putative  33.98 
 
 
1035 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05102  FACT complex subunit spt16 (Facilitates chromatin transcription complex subunit spt16) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2X8]  33.2 
 
 
1019 aa  481  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000406367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85971  global regulator of transcription  31.9 
 
 
1026 aa  466  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  24.89 
 
 
366 aa  67  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  25.3 
 
 
376 aa  65.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25.5 
 
 
357 aa  62.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.02 
 
 
351 aa  59.7  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.02 
 
 
351 aa  59.7  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  34.19 
 
 
357 aa  59.7  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  26.76 
 
 
353 aa  55.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  23.33 
 
 
363 aa  55.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  24.14 
 
 
356 aa  55.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  20.5 
 
 
405 aa  55.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  20.5 
 
 
405 aa  55.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  21.02 
 
 
433 aa  54.7  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  24.88 
 
 
359 aa  54.3  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  23.43 
 
 
358 aa  53.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  22.01 
 
 
439 aa  53.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  28.26 
 
 
380 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  30.69 
 
 
353 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  22.61 
 
 
356 aa  53.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  22.86 
 
 
358 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  27.91 
 
 
358 aa  53.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  24.39 
 
 
359 aa  53.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  23.53 
 
 
356 aa  52.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  27.54 
 
 
380 aa  52.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  24.3 
 
 
353 aa  52.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  22.47 
 
 
359 aa  52.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  21.85 
 
 
446 aa  52.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  21.85 
 
 
446 aa  52.4  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  24.3 
 
 
353 aa  52  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.64 
 
 
357 aa  51.6  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  22.39 
 
 
400 aa  51.6  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2140  putative endopeptidase  19.78 
 
 
405 aa  51.2  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332227  normal  0.318783 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  25.69 
 
 
465 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  26.05 
 
 
359 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  25.49 
 
 
355 aa  51.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  26 
 
 
388 aa  51.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  21.54 
 
 
366 aa  51.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  22.27 
 
 
351 aa  50.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  24.3 
 
 
353 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.3 
 
 
353 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  26.9 
 
 
356 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5777  aminopeptidase  27.19 
 
 
324 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149254  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  27.14 
 
 
356 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  31.71 
 
 
353 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  31.71 
 
 
353 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  22.33 
 
 
356 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  25.65 
 
 
356 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  22.5 
 
 
361 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  49.7  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2141  peptidase M24  25.71 
 
 
377 aa  49.7  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.776272  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  21.2 
 
 
406 aa  49.7  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  21.2 
 
 
406 aa  49.7  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  22.5 
 
 
361 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  24.72 
 
 
374 aa  49.7  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3224  aminopeptidase P  25.32 
 
 
444 aa  49.3  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  23.83 
 
 
353 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  26.09 
 
 
380 aa  49.3  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  24.76 
 
 
379 aa  49.3  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0291  peptidase M24  22.81 
 
 
337 aa  48.9  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  22.5 
 
 
361 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  22.81 
 
 
361 aa  48.9  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  22.5 
 
 
361 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.53 
 
 
369 aa  48.9  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  22.5 
 
 
361 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  22.5 
 
 
361 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  27.78 
 
 
404 aa  48.5  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  20.94 
 
 
361 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  20.58 
 
 
361 aa  48.1  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  25.21 
 
 
323 aa  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  22.61 
 
 
363 aa  47.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  28.65 
 
 
360 aa  48.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1923  peptidase M24  24.58 
 
 
361 aa  48.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.412191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.44 
 
 
356 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  25.36 
 
 
381 aa  48.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  26.5 
 
 
353 aa  47.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  23.08 
 
 
361 aa  47  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  27.54 
 
 
399 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  23.48 
 
 
400 aa  47  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  22.14 
 
 
397 aa  47  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  23.33 
 
 
354 aa  47.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.03 
 
 
354 aa  47  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  24.79 
 
 
386 aa  47  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  23.97 
 
 
353 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  27.7 
 
 
362 aa  46.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  25.27 
 
 
374 aa  46.6  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  25.12 
 
 
441 aa  46.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  24.28 
 
 
372 aa  45.8  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  28.46 
 
 
354 aa  45.8  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  26.8 
 
 
408 aa  46.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1485  peptidase M24  26.29 
 
 
413 aa  45.8  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  26.36 
 
 
354 aa  46.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>