More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11674 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11674  predicted protein  100 
 
 
585 aa  1208    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  40.54 
 
 
655 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.02 
 
 
628 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  41.15 
 
 
612 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  40.98 
 
 
612 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  41.62 
 
 
610 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.23 
 
 
625 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  39.36 
 
 
661 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.48 
 
 
628 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  41.15 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  40.98 
 
 
625 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  40.88 
 
 
646 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  39.36 
 
 
651 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  39.53 
 
 
651 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  39.76 
 
 
672 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  40.2 
 
 
657 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  39.53 
 
 
672 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  40.27 
 
 
606 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2340  ABC transporter related  42.39 
 
 
604 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  41.98 
 
 
626 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
592 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  40.57 
 
 
628 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  44.53 
 
 
612 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0348  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  40.03 
 
 
605 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  39.36 
 
 
652 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  41.86 
 
 
607 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  42.35 
 
 
617 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  44.15 
 
 
612 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  38.83 
 
 
623 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  40.2 
 
 
655 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  38.83 
 
 
623 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1975  ABC transporter related  40.78 
 
 
607 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  38.83 
 
 
623 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0722  ABC transporter related  39.93 
 
 
627 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  39.83 
 
 
611 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  39.8 
 
 
640 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  39.8 
 
 
647 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  39.44 
 
 
654 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  39.15 
 
 
623 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  42.61 
 
 
606 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  41.16 
 
 
607 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  38.83 
 
 
623 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  39.77 
 
 
663 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0572  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.5 
 
 
651 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0439  putative composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  41.19 
 
 
621 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  38.86 
 
 
652 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  39.66 
 
 
644 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0585  ABC transporter related  38.92 
 
 
623 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  39.83 
 
 
662 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0688  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.59 
 
 
623 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0867  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  38.59 
 
 
654 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3300  ABC transporter related  40.14 
 
 
609 aa  422  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0999456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0702  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.59 
 
 
623 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  38.99 
 
 
623 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0204  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.59 
 
 
623 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0581  ABC transporter related  41.92 
 
 
603 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  38.91 
 
 
622 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0602  ABC transporter related  39.32 
 
 
603 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2585  ABC transporter related  39.97 
 
 
637 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.695823  decreased coverage  0.00374434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  39.08 
 
 
606 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2740  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.59 
 
 
623 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 
630 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2338  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.59 
 
 
623 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.587388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  40.88 
 
 
595 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0393  ABC transporter related  39.59 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2418  heavy metal ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.59 
 
 
623 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  41.92 
 
 
629 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  40.03 
 
 
596 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  39.9 
 
 
624 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3493  ABC transporter related  41.9 
 
 
608 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4027  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.51 
 
 
656 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  40.03 
 
 
596 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  38.82 
 
 
625 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3460  ABC transporter related  43.68 
 
 
621 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
593 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.96 
 
 
627 aa  410  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0672  ABC transporter related  39.34 
 
 
629 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.798433  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  40 
 
 
604 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  40.03 
 
 
631 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  43.76 
 
 
920 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3858  ABC transporter-related protein  38.95 
 
 
589 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121089  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  40.38 
 
 
606 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  36.91 
 
 
597 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3906  ABC transporter related  42.75 
 
 
619 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1349  ABC transporter related  41.31 
 
 
608 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4079  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 
590 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4026  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
619 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  39.52 
 
 
608 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  37.37 
 
 
597 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
603 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  38.15 
 
 
594 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  38.15 
 
 
596 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  38.32 
 
 
598 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  38.15 
 
 
598 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28662  ABC(ABCB) family transporter: mitochondrial homolog (ABCB)  38.34 
 
 
654 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  37.43 
 
 
590 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3702  ABC transporter related  37.97 
 
 
598 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19150  ABC transporter, composite transmembrane permease and ATP binding components  39.68 
 
 
615 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  38.15 
 
 
598 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  38.03 
 
 
591 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.603716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>