46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3023 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  95.45 
 
 		 264 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  67.92 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  60.38 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.51 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.51 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  55.12 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  55.12 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.12 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  54.72 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.12 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  55.12 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.29 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  54.72 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  52.76 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  54.33 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.33 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.33 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  54.51 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  53.85 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  47.6 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  47.6 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  47.6 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  34.38 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  30.61 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  26.07 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  31.06 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1255  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  28.79 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1281  hypothetical protein  28.03 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1253  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  28.03 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0262846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1455  hypothetical protein  28.03 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.785741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1383  hypothetical protein  28.03 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.072705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  28.79 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  28.79 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1288  putative enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  28.03 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1524  hypothetical protein  26.52 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2029  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2197  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0676988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2213  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.37928e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2042  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0602824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3625  hypothetical protein  25.58 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2829  hypothetical protein  24.6 
 
 		 276 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1518  hypothetical protein  24.6 
 
 		 276 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1553  hypothetical protein  24.6 
 
 		 276 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0114  hypothetical protein  23.19 
 
 		 286 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>