49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4364 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  35.55 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  34.38 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  32.4 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  32.3 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  32.03 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  32.93 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.07 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.07 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.07 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.25 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  30 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.46 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.46 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  28.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  28.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  28.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.93 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.93 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.67 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.51 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.76 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3625  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2197  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0676988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2213  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.37928e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2042  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0602824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  26.72 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2029  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1288  putative enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  24.62 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1255  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  23.85 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1253  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  23.85 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0262846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1281  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1455  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.785741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1383  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.072705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1524  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  25.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  25.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1527  hypothetical protein  23.44 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2638  hypothetical protein  24.37 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2571  hypothetical protein  24.01 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2829  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1553  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1518  hypothetical protein  23.08 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0824  hypothetical protein  29.52 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>