36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2674 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.06 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  98.45 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  91.09 
 
 		 258 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  91.13 
 
 		 248 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  91.13 
 
 		 248 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  89.15 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  90.32 
 
 		 248 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  89.24 
 
 		 251 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.51 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.51 
 
 		 264 aa  285  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.08 
 
 		 264 aa  281  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  52.94 
 
 		 264 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  50 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  44.11 
 
 		 317 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  44.11 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  44.11 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  28.46 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  28.23 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  27.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  26.8 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3625  hypothetical protein  28.03 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1383  hypothetical protein  25.86 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.072705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1281  hypothetical protein  25.86 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1253  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  25.86 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0262846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1255  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  25.86 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1455  hypothetical protein  25.86 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.785741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  25.86 
 
 		 132 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  25.86 
 
 		 132 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  25.86 
 
 		 132 aa  42  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>