26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1285 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  93.06 
 
 		 317 aa  588  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  69.29 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  48.71 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  47.6 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  47.35 
 
 		 264 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  47.53 
 
 		 264 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  44.65 
 
 		 264 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  44.4 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.85 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.66 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.28 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  42.91 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  42.91 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  42.91 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  42.91 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  42.91 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  42.54 
 
 		 258 aa  215  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.85 
 
 		 248 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.85 
 
 		 248 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  44.23 
 
 		 248 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  42.54 
 
 		 258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  29.34 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  28.57 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  25.1 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>