19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3625 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  31.82 
 
 		 255 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  30.65 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.23 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  34.19 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  25.58 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.01 
 
 		 258 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  25.58 
 
 		 264 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.03 
 
 		 258 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  28.03 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.06 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  30.36 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>