36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2797 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.01 
 
 
258 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.01 
 
 
248 aa  493  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.01 
 
 
248 aa  493  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  98.01 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  89.24 
 
 
258 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  88.45 
 
 
258 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  88.05 
 
 
258 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  85.26 
 
 
264 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  54.25 
 
 
264 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  53.39 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  53.85 
 
 
264 aa  268  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  54.98 
 
 
264 aa  267  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  50.6 
 
 
276 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.85 
 
 
317 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.85 
 
 
305 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  43.85 
 
 
305 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  27.76 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  27.64 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  27.6 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  27.93 
 
 
132 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1518  hypothetical protein  22.93 
 
 
276 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1527  hypothetical protein  22.93 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1553  hypothetical protein  22.56 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2829  hypothetical protein  22.56 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93181  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1281  hypothetical protein  27.03 
 
 
132 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1253  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  27.03 
 
 
132 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0262846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1383  hypothetical protein  27.03 
 
 
132 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.072705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1255  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  27.1 
 
 
132 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1455  hypothetical protein  27.03 
 
 
132 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.785741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>