50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1112 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  69.43 
 
 
264 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  69.06 
 
 
264 aa  380  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  66.67 
 
 
264 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.86 
 
 
258 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  57.25 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  57.25 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  57.25 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  57.25 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  57.25 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.86 
 
 
258 aa  285  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.86 
 
 
258 aa  284  9e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.47 
 
 
258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.08 
 
 
258 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  53.15 
 
 
276 aa  275  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.08 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.63 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  56.63 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.78 
 
 
251 aa  271  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  55.82 
 
 
248 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  48.11 
 
 
305 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  48.11 
 
 
317 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  48.11 
 
 
305 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  32.3 
 
 
255 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  28.98 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  28.12 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1383  hypothetical protein  31.54 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.072705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1253  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  31.54 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0262846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1455  hypothetical protein  31.54 
 
 
132 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.785741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1281  hypothetical protein  31.54 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1255  enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  30.77 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1481  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1524  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1288  putative enhancer of serine sensitivity, N-terminal region  30 
 
 
132 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1417  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3926  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0114  hypothetical protein  25 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2746  hypothetical protein  23.36 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2571  hypothetical protein  23.36 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3625  hypothetical protein  29.57 
 
 
146 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2829  hypothetical protein  22.1 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93181  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1553  hypothetical protein  22.1 
 
 
276 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2638  hypothetical protein  22.99 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1518  hypothetical protein  21.72 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1527  hypothetical protein  21.05 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2197  hypothetical protein  26.12 
 
 
145 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0676988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2213  hypothetical protein  26.12 
 
 
145 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.37928e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2042  hypothetical protein  26.12 
 
 
145 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0602824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0708  hypothetical protein  22.11 
 
 
275 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>