39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3619 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  70.26 
 
 
305 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  70.26 
 
 
317 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  70.26 
 
 
305 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  53.15 
 
 
264 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  52.76 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  50.6 
 
 
251 aa  265  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  51.17 
 
 
258 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  53.15 
 
 
264 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  50 
 
 
258 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  50 
 
 
258 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  52.31 
 
 
264 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  50.4 
 
 
248 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  50.4 
 
 
248 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  49.61 
 
 
258 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  49.61 
 
 
258 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  49.61 
 
 
258 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  49.61 
 
 
258 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  49.61 
 
 
258 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  49.22 
 
 
258 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  50.4 
 
 
248 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  50.38 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  48.83 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  32.4 
 
 
255 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  29.57 
 
 
252 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  26.38 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3625  hypothetical protein  30.65 
 
 
146 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1553  hypothetical protein  23.69 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2829  hypothetical protein  23.69 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.93181  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1527  hypothetical protein  23.69 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1518  hypothetical protein  23.34 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1086  hypothetical protein  28 
 
 
132 aa  45.4  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2638  hypothetical protein  27.27 
 
 
276 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2571  hypothetical protein  27.66 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2029  hypothetical protein  27.52 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2746  hypothetical protein  27.66 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2213  hypothetical protein  24.56 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.37928e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2197  hypothetical protein  24.56 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0676988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2042  hypothetical protein  24.56 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0602824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>