40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3430 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2457  hypothetical protein  40.94 
 
 		 145 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1816  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0824  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3553  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0763893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1360  hypothetical protein  39.26 
 
 		 137 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8054e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3028  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.14 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000152903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2853  hypothetical protein  39.26 
 
 		 137 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.785345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0570  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.88 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4364  SseB family protein  27.69 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.606742  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0872  SseB family protein  26.81 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179589  decreased coverage  0.000000000216003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0589  hypothetical protein  27.05 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1252  enhanced serine sensitivity protein SseB  26.07 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3023  enhanced serine sensitivity protein SseB  26.07 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2177  hypothetical protein  26.79 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.643513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1112  enhanced serine sensitivity protein SseB  28.12 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0657  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3619  enhanced serine sensitivity protein SseB  26.38 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.382395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3651  hypothetical protein  25.48 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1176  enhanced serine sensitivity protein SseB  25.1 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2743  enhanced serine sensitivity protein SseB  29.02 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1285  enhanced serine sensitivity protein SseB  25.1 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0427  enhanced serine sensitivity protein SseB  25.1 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1652  hypothetical protein  23.56 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6083  hypothetical protein  23.56 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3019  enhanced serine sensitivity protein SseB  26.14 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.847607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2797  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.6 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2734  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.08 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2775  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.08 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2690  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.08 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2909  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.08 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1146  SseB family protein  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02378  hypothetical protein  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2673  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2806  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02414  rhodanase-like enzyme, sulfur transfer from thiosulfate  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1155  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.32 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3752  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.32 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2897  enhanced serine sensitivity protein SseB  27.32 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2674  enhanced serine sensitivity protein SseB  26.8 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.748628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>