More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55020  ABC transporter permease  100 
 
 		 340 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000520713  unclonable  2.14331e-21 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  40.26 
 
 		 333 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  35.33 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.95 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.7 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  36.69 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  37.33 
 
 		 333 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  37.86 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001071  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuD  38.52 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01764  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  36.66 
 
 		 327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  33.04 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  33.04 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  33.04 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  33.23 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  37.84 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  37.7 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  37 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  30.49 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  37.38 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  38.89 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  39.1 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  36.98 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.55 
 
 		 452 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.66 
 
 		 351 aa  155  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  35.64 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  34.55 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  34.55 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  36.18 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  32.69 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1392  transport system permease protein  34.97 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.102403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  30.18 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  39.79 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  32.26 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  32.26 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  36.93 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  38.14 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.06 
 
 		 644 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  35.85 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  36.09 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1047  transport system permease protein  32.64 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  33.33 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  32.84 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  33.45 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  37.1 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  33.14 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  33.14 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  39.01 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  32.58 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  33.12 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  37.94 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  32.84 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  32.84 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  35.28 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  38.64 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 325 aa  146  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  32.84 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  37.37 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.85 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  35.8 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  33.02 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  33.02 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  29.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  29.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  31.96 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  34.2 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  31.96 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  31.96 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  35.39 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  33.87 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.87 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  33.87 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  33.87 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  34.21 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 338 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  33.23 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  35.39 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0396  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  32.31 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0318  ferrichrome transport system permease  32.26 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0507697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>