More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05721 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_05721  glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
306 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.832335 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13731  glutamate--tRNA ligase  54.1 
 
 
312 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.259862  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2091  glutamyl-tRNA synthetase-like  58.76 
 
 
293 aa  326  3e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0580  glutamyl-tRNA synthetase-like  56.94 
 
 
293 aa  315  5e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.250352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0306  Glutamate--tRNA ligase  43.93 
 
 
323 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07310  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
318 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1396  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  40.97 
 
 
334 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.535698  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1332  Glutamate--tRNA ligase  38.06 
 
 
311 aa  187  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000257577  decreased coverage  0.00027046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0605  glutamate--tRNA ligase  42.57 
 
 
316 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3769  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.03 
 
 
301 aa  185  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0219396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2226  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.48 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0797  glutamate--tRNA ligase  41.87 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0319  glutamate--tRNA ligase  42.86 
 
 
337 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468556  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2004  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.266458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13470  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0295  glutamate--tRNA ligase  44.13 
 
 
323 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0570  Glutamate--tRNA ligase  40.77 
 
 
319 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0867  Glutamate--tRNA ligase  41.58 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5657  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.46 
 
 
297 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2581  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  43.01 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1251  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.27 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1703  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.52 
 
 
298 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2315  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.52 
 
 
298 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2234  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.69 
 
 
294 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0962  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.63 
 
 
298 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294785  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0317  Glutamate--tRNA ligase  43.93 
 
 
323 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2338  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.13 
 
 
298 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0414  Glutamate--tRNA ligase  40 
 
 
309 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1109  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
299 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3294  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  41.04 
 
 
296 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1031  glutamate--tRNA ligase  41.7 
 
 
283 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1023  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  41.95 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.202098  hitchhiker  0.00000345941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1882  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.75 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0676  glutamate--tRNA ligase  40.24 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2081  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  40.48 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178855  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002564  glutamyl-Q-tRNA synthetase  37.96 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000502231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0900  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.86 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0982  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1586  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  37.32 
 
 
313 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.384476  normal  0.0681988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2014  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.31 
 
 
311 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3450  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.6 
 
 
330 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2408  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.23 
 
 
314 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0583  glutamate--tRNA ligase  38.75 
 
 
308 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1195  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0519068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1915  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00194048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1041  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.512398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1353  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0827  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1203  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.603954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0324  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.68 
 
 
297 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3764  Glutamate--tRNA ligase  41.57 
 
 
297 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0851  Glutamate--tRNA ligase  40.65 
 
 
313 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.31695  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02060  glutamyl- or glutaminyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
311 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2698  glutamyl- and glutaminyl- tRNA synthetase  41.87 
 
 
311 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000386478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0334  Glutamate--tRNA ligase  34.48 
 
 
373 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.374336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0927  glutamyl-tRNA synthetase-related protein  42.62 
 
 
296 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1046  Glutamate--tRNA ligase  42.62 
 
 
296 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2709  glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.63084  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4720  glutamate--tRNA ligase  37.69 
 
 
292 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2354  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.29 
 
 
297 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0532352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1769  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.39 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3469  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.61 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000116518  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3799  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  36.36 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000213424  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1780  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  39.02 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.234416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3339  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.84 
 
 
321 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000626145  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0922  glutamate--tRNA ligase  39.07 
 
 
300 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0947  Glutamate--tRNA ligase  43.03 
 
 
313 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.507725  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2900  glutamate--tRNA ligase  41.04 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0201877  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0673  glutamate--tRNA ligase  40.08 
 
 
305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.930403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1031  Glutamate--tRNA ligase  38.41 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.011538  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2934  glutamate--tRNA ligase  38.81 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0900886  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1006  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.84 
 
 
384 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000329322  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2210  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.02 
 
 
315 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895513  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4692  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.26 
 
 
295 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000687127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0779  glutamyl-tRNA synthetase domain-containing protein  37.6 
 
 
290 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00289158  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1329  tRNA synthetase class I domain-containing protein  39.15 
 
 
314 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3373  glutamate--tRNA ligase  40.08 
 
 
298 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0303473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4726  Glutamate--tRNA ligase  39.49 
 
 
316 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1188  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  40.17 
 
 
310 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0787184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0740  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.84 
 
 
295 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000657167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4694  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.43 
 
 
300 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4558  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.43 
 
 
300 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000548174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4042  Glutamate--tRNA ligase  40.6 
 
 
285 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0126  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  34.96 
 
 
296 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3371  glutamate--tRNA ligase  39.31 
 
 
309 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
479 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1905  glutamate--tRNA ligase  37.96 
 
 
309 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5575  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  38.27 
 
 
310 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00405  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  42.55 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1393  glutamyl-tRNA synthetase, class Ic  38.41 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3936  glutamate--tRNA ligase  39.02 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000130965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3586  glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase  39.58 
 
 
294 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3073  glutamyl-tRNA synthetase class Ic  39.51 
 
 
310 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
464 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
469 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
469 aa  155  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
469 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2820  Glutamate--tRNA ligase  38.82 
 
 
302 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00525716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
473 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3986  glutamate--tRNA ligase  38.84 
 
 
303 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000239485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>