123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_01851 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_01851  translation initiation factor SUI1  100 
 
 		 103 aa  199  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01831  translation initiation factor SUI1  91.26 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0167  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  88.35 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0710304  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01941  translation initiation factor SUI1  71.84 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.2 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.42 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  40.2 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  33.68 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2099  putative translation initiation factor SUI1  38.46 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  37.04 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01821  translation initiation factor SUI1  40.78 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  34.74 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  42.86 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  36.84 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  47.06 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.57 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  36.46 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  42.7 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  35.42 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  42.53 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  45.71 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  44.29 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.24 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  41.03 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  47.83 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  34.41 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000152  translation initiation factor SUI1-related protein  42.86 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.12 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  35.9 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  35.9 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  44.93 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  38.57 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  38.57 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  47.14 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  41.43 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  44.12 
 
 		 184 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  40.85 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000865275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  43.48 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  34.78 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  37.8 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  43.42 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000045449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  41.43 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  33.8 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  35.71 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  39.74 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  36.96 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2471  translation initiation factor Sui1  38.1 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.827071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  30.11 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  40.85 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000470884  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  40.85 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  40.85 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  35.23 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  41.33 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0210  translation initiation factor SUI1  39.68 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  42.03 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1163  translation initiation factor SUI1  50 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0953729  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  41.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000141332  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  41.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000000000433453  decreased coverage  0.0000613351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  41.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000000776224  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  36.67 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  46.43 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.64 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  40.54 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3637  translation initiation factor SUI1  44.07 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  48.21 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  41.89 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  38.57 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000686676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  44.64 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000598621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  0.000000015805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000972273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1917  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000003145  hitchhiker  0.00000000000000420932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  44.64 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000764802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  44.64 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000134227  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1990  translation initiation factor Sui1  37.84 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  38.57 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3580  translation initiation factor SUI1  36 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  38.57 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  34.88 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  39.19 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  35.16 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0627  translation initiation factor Sui1  34.18 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.344568  normal  0.0369514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1391  translation initiation factor Sui1  40 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000199492  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2534  translation initiation factor Sui1  34.18 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  42.86 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>