69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_R0055 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0053  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0040  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0020  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00132609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  84.29 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1351  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0066  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3271  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3267  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3205  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.582072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3192  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3372  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4154  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0729117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0049  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0023  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0016  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.465569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0069  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.448955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0002  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0038  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0073  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.423139  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4305  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  83.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA61  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t25  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532363  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0016  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00054  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627251  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0552  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0183595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0010  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0087  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0256242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0012  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0007  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4697  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00274412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5067  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0022  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0014  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.472539  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0091  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0078  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0018  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.268435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2997  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0012  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  82.86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0009  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3531  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0015  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.660647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>