13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_t0038 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_t0038  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1351  tRNA-Gly  94.03 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000889574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0053  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0105  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0010  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000890025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1388  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.276257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0055  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0006  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000876762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1383  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0556361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>