More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4234 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4234  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.24 
 
 
302 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.24 
 
 
302 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.84 
 
 
300 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.53 
 
 
302 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
300 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.18 
 
 
299 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.18 
 
 
300 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.86 
 
 
300 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.87 
 
 
300 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.28 
 
 
291 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  58.96 
 
 
296 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.28 
 
 
308 aa  368  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  59.27 
 
 
291 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.61 
 
 
308 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.92 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.59 
 
 
290 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.59 
 
 
290 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.25 
 
 
290 aa  358  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  59.4 
 
 
291 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0475  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.67 
 
 
293 aa  341  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1995  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.72 
 
 
292 aa  340  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  56.62 
 
 
294 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.62 
 
 
294 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.95 
 
 
294 aa  338  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0459  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.33 
 
 
293 aa  338  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  57.84 
 
 
296 aa  338  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1059  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  60.4 
 
 
291 aa  338  9e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.92 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3874  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  60.07 
 
 
293 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  58.19 
 
 
294 aa  335  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2677  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.09 
 
 
293 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2569  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.09 
 
 
293 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0531  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.33 
 
 
293 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0369144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5975  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.09 
 
 
293 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0290439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2037  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.09 
 
 
293 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2695  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.09 
 
 
293 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.09 
 
 
293 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1830  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.68 
 
 
297 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.21 
 
 
296 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
309 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0647  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.89 
 
 
293 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0470  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59 
 
 
293 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0818  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
309 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0444  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59 
 
 
293 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0276  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
293 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0977  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
309 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2400  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
309 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
309 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2676  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.22 
 
 
309 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0654  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.89 
 
 
293 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.71 
 
 
291 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.11 
 
 
329 aa  331  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4481  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.38 
 
 
299 aa  331  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1715  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.37 
 
 
296 aa  331  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0555  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.33 
 
 
293 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0437  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.45 
 
 
315 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.188217 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1546  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.68 
 
 
297 aa  331  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.273523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4046  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.03 
 
 
297 aa  330  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4681  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.24 
 
 
297 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690207  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3391  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.7 
 
 
297 aa  329  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.248138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0920  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.91 
 
 
297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0071  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.24 
 
 
297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.657725  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.21 
 
 
290 aa  328  6e-89  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3999  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.98 
 
 
297 aa  328  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00447347  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.96 
 
 
291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0675  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3291  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.67 
 
 
293 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.055129  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3944  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.08 
 
 
297 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0259  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.08 
 
 
298 aa  325  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0244  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.08 
 
 
298 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00287524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3952  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.25 
 
 
298 aa  324  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2700  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.58 
 
 
297 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0712833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0868  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.72 
 
 
297 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.37 
 
 
339 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0494  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.58 
 
 
297 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00647129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  55.59 
 
 
290 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  55.59 
 
 
290 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  55.59 
 
 
290 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  55.25 
 
 
290 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0558  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.55 
 
 
294 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4692  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.44 
 
 
278 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243539  normal  0.0624727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.25 
 
 
290 aa  323  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2718  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59 
 
 
290 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.92 
 
 
290 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.92 
 
 
290 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.92 
 
 
290 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.92 
 
 
290 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0073  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.39 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1712  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.25 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000488302  hitchhiker  5.80256e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4683  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.26 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5191  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.92 
 
 
297 aa  318  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>