More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1830 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1830  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.218486  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1546  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  97.64 
 
 
297 aa  590  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.273523  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5191  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  89.9 
 
 
297 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4683  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  89.56 
 
 
298 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3944  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  88.22 
 
 
297 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4046  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  87.54 
 
 
297 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3391  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  87.21 
 
 
297 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.248138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0868  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  87.21 
 
 
297 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3363  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  87.88 
 
 
297 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0920  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  86.87 
 
 
297 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0071  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  87.21 
 
 
297 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.657725  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0494  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  86.87 
 
 
297 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00647129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2700  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  86.87 
 
 
297 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0712833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4681  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  84.85 
 
 
297 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.690207  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3952  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  85.19 
 
 
298 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.087179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0475  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.83 
 
 
293 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0459  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.16 
 
 
293 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0470  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.5 
 
 
293 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0555  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
293 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0531  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
293 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0369144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0444  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
293 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.822048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3291  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.49 
 
 
293 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.055129  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0654  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.48 
 
 
293 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.14 
 
 
309 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0647  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.14 
 
 
293 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0675  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.82 
 
 
293 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0818  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.14 
 
 
309 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.364811  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0276  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0977  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
309 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5975  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0290439 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2400  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
309 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2677  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2569  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2037  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
309 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2695  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2676  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.81 
 
 
309 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638427  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2729  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.84 
 
 
298 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4481  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.38 
 
 
299 aa  444  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1995  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  71.04 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.08 
 
 
290 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.08 
 
 
290 aa  374  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  65.08 
 
 
291 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.08 
 
 
290 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.73 
 
 
308 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  63.73 
 
 
296 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.75 
 
 
290 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.28 
 
 
299 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.96 
 
 
300 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.71 
 
 
308 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  60.27 
 
 
291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
300 aa  361  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.96 
 
 
300 aa  360  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.05 
 
 
291 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.09 
 
 
302 aa  358  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.09 
 
 
302 aa  358  7e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  358  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.75 
 
 
302 aa  358  8e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.62 
 
 
300 aa  355  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3999  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.61 
 
 
297 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00447347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2718  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.63 
 
 
290 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1059  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  58.92 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.71 
 
 
291 aa  337  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.81 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.04 
 
 
291 aa  335  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.91 
 
 
293 aa  333  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.82 
 
 
290 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  57.48 
 
 
290 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1299  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  56.81 
 
 
294 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.825438  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  57.14 
 
 
296 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.38 
 
 
300 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0924  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.22 
 
 
291 aa  333  3e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794119  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0259  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.26 
 
 
298 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0024  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.88 
 
 
300 aa  332  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.48 
 
 
290 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0244  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.73 
 
 
298 aa  332  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00287524 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0956  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  54.88 
 
 
290 aa  332  6e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.54 
 
 
291 aa  331  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1715  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.22 
 
 
296 aa  331  7.000000000000001e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.9 
 
 
292 aa  330  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  55.56 
 
 
290 aa  330  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.08 
 
 
290 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.37 
 
 
339 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  56.9 
 
 
291 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.8 
 
 
290 aa  329  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1387  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.341558  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2965  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
290 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
290 aa  328  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  55.89 
 
 
290 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>