40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0824 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0824  heat shock protein 15  100 
 
 		 94 aa  184  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  45.16 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00885  heat shock protein 15  44.57 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.467007  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0165  heat shock protein 15  40.45 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0051  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.36 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6407  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.48 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0756783  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0859  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1589  RNA-binding S4  42.39 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292038  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.49 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  46.81 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  37.23 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3766  RNA-binding S4 domain protein  41.94 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.87 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1642  RNA-binding S4  37.63 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.605711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0188  RNA-binding S4 domain protein  37.63 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0783  RNA-binding S4 domain protein  39.36 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26490  heat shock protein Hsp15  39.58 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468539  normal  0.352785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1173  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.44 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  42 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  43.68 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2951  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.96 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  37.23 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.66 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  35.11 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.54 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1306  RNA-binding S4 domain protein  36.73 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.424308  decreased coverage  0.000297946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12510  heat shock protein Hsp15  37.36 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.96 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3883  RNA-binding S4 domain protein  36.26 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0142  RNA-binding S4 domain protein  33.75 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  39.39 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  39 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  26.88 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3582  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.41 
 
 		 127 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  35.11 
 
 		 133 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  31.87 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.25 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  30.39 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.96 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5459  RNA-binding S4 domain protein  32.98 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507195  normal  0.0728213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>