27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28491 on replicon NC_009372
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009372  OSTLU_28491  predicted protein  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000396054  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_93979  predicted protein  95.54 
 
 
129 aa  218  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00475379  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_3884  predicted protein  63.11 
 
 
353 aa  139  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0376581  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.63 
 
 
467 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.47 
 
 
403 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000650417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  32.58 
 
 
429 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.3 
 
 
447 aa  45.1  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.83 
 
 
457 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  31.25 
 
 
437 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  28.77 
 
 
444 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.09 
 
 
418 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.82 
 
 
906 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0697467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  32.29 
 
 
438 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  33.03 
 
 
424 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  30.69 
 
 
388 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.93 
 
 
457 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.23 
 
 
438 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.72 
 
 
387 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  27.01 
 
 
413 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  34.74 
 
 
437 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.3 
 
 
444 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.72 
 
 
388 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.69 
 
 
391 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3042  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.15 
 
 
419 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  31.25 
 
 
438 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  30.56 
 
 
427 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.73 
 
 
388 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>