More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3884 on replicon NC_009372
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009372  OSTLU_3884  predicted protein  100 
 
 
353 aa  725    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0376581  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.27 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  30.66 
 
 
440 aa  159  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.36 
 
 
424 aa  157  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  30.2 
 
 
445 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.86 
 
 
445 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.14 
 
 
447 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  29.4 
 
 
494 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  31.28 
 
 
437 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  31.07 
 
 
437 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  29.62 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  29.62 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  30.17 
 
 
444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  29.51 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  29.78 
 
 
441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  30.34 
 
 
435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  31.49 
 
 
440 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  30.34 
 
 
436 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.06 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  28.49 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  30.57 
 
 
436 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  30.14 
 
 
446 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.14 
 
 
446 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  30.64 
 
 
431 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.44 
 
 
437 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.36 
 
 
446 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.42 
 
 
445 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  29.2 
 
 
443 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  29.56 
 
 
445 aa  143  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1810  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.94 
 
 
402 aa  142  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.75 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.2 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.57 
 
 
442 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  27.91 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.78 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.64 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.13 
 
 
438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  29.75 
 
 
438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.18 
 
 
433 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.44 
 
 
450 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  28.45 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  29.48 
 
 
438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.77 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  29.18 
 
 
450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.7 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.09 
 
 
458 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.11 
 
 
454 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  27.9 
 
 
440 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28491  predicted protein  63.11 
 
 
210 aa  139  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000396054  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.62 
 
 
445 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  30.94 
 
 
447 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.9 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_93979  predicted protein  66.33 
 
 
129 aa  139  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00475379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  29.48 
 
 
438 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  29.2 
 
 
438 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.08 
 
 
449 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  28.73 
 
 
445 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.62 
 
 
452 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.7 
 
 
439 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.17 
 
 
460 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  28.49 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  28.45 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.91 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  28.57 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.78 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.73 
 
 
467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.49 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  28.57 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 
427 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  28.21 
 
 
438 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  27.79 
 
 
438 aa  136  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  28.02 
 
 
450 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.42 
 
 
448 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  29.4 
 
 
494 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.01 
 
 
436 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.49 
 
 
457 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  29.81 
 
 
429 aa  135  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.69 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  28.34 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.61 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  27.91 
 
 
467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.57 
 
 
446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.53 
 
 
459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  29.41 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.79 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.75 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.45 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  28.29 
 
 
443 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.44 
 
 
431 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  28.77 
 
 
439 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  29.28 
 
 
464 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.17 
 
 
453 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.64 
 
 
464 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  28.97 
 
 
470 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  29.09 
 
 
464 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.21 
 
 
438 aa  132  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.11 
 
 
466 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.98 
 
 
488 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.9 
 
 
440 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.9 
 
 
440 aa  132  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>