33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0196 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  38.89 
 
 
173 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  35.48 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0868  hypothetical protein  37.11 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1038  hypothetical protein  40.16 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000431275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  30.72 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  34.58 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  27.05 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  51.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  29.17 
 
 
116 aa  50.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  29.46 
 
 
308 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  29.41 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  26.5 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  27.21 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  29.6 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  29.6 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  27.62 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  25 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  29.73 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  26.09 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  26.72 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1195  hypothetical protein  33 
 
 
370 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  30.95 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  29.41 
 
 
121 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  25.98 
 
 
112 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  27.34 
 
 
123 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  34.26 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1321  hypothetical protein  23.93 
 
 
263 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  26.05 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  24.44 
 
 
123 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  29.17 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  25 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>