29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1038 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  903    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000431275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  41.25 
 
 		 183 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  38.52 
 
 		 159 aa  76.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  29.25 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  31.53 
 
 		 116 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  30.06 
 
 		 173 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  31.25 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  27.88 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  31.78 
 
 		 123 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  30.93 
 
 		 117 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1195  hypothetical protein  26.03 
 
 		 370 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  33.68 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  31.82 
 
 		 155 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  31.53 
 
 		 123 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  28.85 
 
 		 125 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  30.43 
 
 		 174 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  31.18 
 
 		 114 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  32.38 
 
 		 121 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  33 
 
 		 127 aa  46.6  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  29.03 
 
 		 120 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  31.13 
 
 		 115 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0868  hypothetical protein  29.49 
 
 		 163 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  27.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>