33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0868 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0868  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  324  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0933  hypothetical protein  31.06 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2212  hypothetical protein  31.65 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00418947  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0275  hypothetical protein  30.99 
 
 
146 aa  57.4  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.560646  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  32.98 
 
 
106 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  30.3 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1038  hypothetical protein  36.04 
 
 
441 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000431275  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0934  hypothetical protein  28.97 
 
 
308 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0737095  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  25.26 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1195  hypothetical protein  31 
 
 
370 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  29.7 
 
 
126 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  34.04 
 
 
100 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  29.46 
 
 
123 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  29.7 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  31.96 
 
 
123 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  31.07 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  31.87 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1321  hypothetical protein  32.74 
 
 
263 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  28.81 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  27.18 
 
 
159 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  28 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  22.79 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  28.43 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  30.69 
 
 
131 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1691  hypothetical protein  24.84 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.554195  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  28.16 
 
 
116 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  27.88 
 
 
393 aa  41.6  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  26.8 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  23.96 
 
 
114 aa  40.8  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  30.11 
 
 
120 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>