More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4169 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4169  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 
459 aa  873    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  59.33 
 
 
536 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19500  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  56.27 
 
 
576 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132441  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3908  sulphate transporter  49.08 
 
 
557 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0425  sulphate transporter  57.42 
 
 
582 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4401  sulphate transporter  45.45 
 
 
549 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4315  sulphate transporter  45.45 
 
 
549 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3029  sulphate transporter  46.62 
 
 
549 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1119  sulphate transporter  49.24 
 
 
546 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2465  sulphate transporter  47.67 
 
 
546 aa  207  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320203  decreased coverage  0.00514746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0873  SulP family sulfate permease  60.16 
 
 
597 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02290  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  48.29 
 
 
585 aa  203  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5693  sulphate transporter  45.56 
 
 
548 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.108223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4695  sulphate transporter  45.82 
 
 
549 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.582462  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2086  sulphate transporter  49.81 
 
 
554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0836406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2042  sulphate transporter  49.43 
 
 
564 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  33.21 
 
 
551 aa  156  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  32.85 
 
 
551 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6230  sulphate transporter  47.01 
 
 
590 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  35.34 
 
 
567 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2343  sulphate transporter  43.83 
 
 
551 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.968955  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  35.27 
 
 
570 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  34.94 
 
 
567 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  33.7 
 
 
583 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  35.21 
 
 
581 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  29.45 
 
 
568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  31.79 
 
 
587 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  36.89 
 
 
559 aa  130  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  31.6 
 
 
556 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  30.68 
 
 
570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  29.77 
 
 
568 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  36.06 
 
 
552 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  35.69 
 
 
563 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  32.67 
 
 
560 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  34.82 
 
 
606 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  35.48 
 
 
563 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0736  sulphate anion transporter  29 
 
 
545 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  32.6 
 
 
568 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1474  sulphate transporter  31.58 
 
 
560 aa  123  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.525598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  32.22 
 
 
594 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  28.9 
 
 
568 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  32.37 
 
 
587 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  38.19 
 
 
572 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  33.2 
 
 
553 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02105  permease protein of sulfate transporter  31.6 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.862998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  32.09 
 
 
604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  31.63 
 
 
730 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24970  Sulphate transporter-SulP-type  35.98 
 
 
553 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  29.55 
 
 
553 aa  114  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  36.44 
 
 
551 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  35.32 
 
 
583 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2189  sulphate transporter  31.73 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  29.56 
 
 
552 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  28.92 
 
 
605 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_002950  PG0022  sulfate permease family protein  32 
 
 
558 aa  109  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  30.74 
 
 
590 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2612  sulphate transporter  35.2 
 
 
555 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  29.74 
 
 
552 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1686  sulfate transporter  28.52 
 
 
552 aa  107  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3882  sulphate transporter  39.13 
 
 
573 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0900185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1668  sulphate transporter  34.38 
 
 
550 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  30.34 
 
 
729 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  35.54 
 
 
581 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  33.47 
 
 
575 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0245  sulfate transporter family protein  28.1 
 
 
605 aa  104  4e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.651817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0497  putative sulfate transporter YchM  31.44 
 
 
565 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  28.3 
 
 
573 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  30.28 
 
 
553 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  32.16 
 
 
572 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.84 
 
 
579 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  35.87 
 
 
577 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  26.39 
 
 
557 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  29.93 
 
 
552 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2581  sulphate transporter  27.71 
 
 
563 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000213177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1754  sulfate permease family protein  25.95 
 
 
536 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0323665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2760  sulphate transporter  38.82 
 
 
607 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.207505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1334  putative sulfate transporter YchM  33.19 
 
 
574 aa  93.6  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.817877  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  30.2 
 
 
560 aa  93.2  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1042  putative sulfate transporter YchM  28.88 
 
 
585 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  33.2 
 
 
605 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1108  sulphate transporter  32.85 
 
 
583 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  31.47 
 
 
573 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1808  sulfate transporter  32.91 
 
 
587 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3553  putative sulfate transporter YchM  31.03 
 
 
588 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0965  putative sulfate transporter YchM  28.82 
 
 
573 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.175193  normal  0.1395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1057  sulphate transporter  28.47 
 
 
574 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0213258  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0640  sulphate transporter  35.61 
 
 
581 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.029925  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  33.76 
 
 
564 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4649  sulfate permease family protein  24.28 
 
 
483 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000779975  unclonable  1.77501e-25 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  26.64 
 
 
496 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0608  putative sulfate transporter YchM  33.61 
 
 
594 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.288861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1995  putative sulfate transporter YchM  35.04 
 
 
562 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  30.12 
 
 
549 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  30.65 
 
 
604 aa  87.8  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  24.54 
 
 
626 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  32.67 
 
 
558 aa  87  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  33.2 
 
 
559 aa  86.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02341  putative sulfate transporter  29.15 
 
 
577 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  26.3 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02351  putative sulfate transporter  26.67 
 
 
550 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>