More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0705 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0705  sulphate transporter  100 
 
 		 570 aa  1108    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1878  sulphate transporter  93.71 
 
 		 572 aa  1007    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.536686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6130  sulfate transporter  56.93 
 
 		 563 aa  515  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0582115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.5 
 
 		 560 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  34 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  31.72 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  32.74 
 
 		 575 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  32.91 
 
 		 575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  32.45 
 
 		 570 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  35 
 
 		 558 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  28.8 
 
 		 567 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  34.24 
 
 		 550 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  30.71 
 
 		 580 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  31.82 
 
 		 565 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.92 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  31.11 
 
 		 576 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  30.43 
 
 		 582 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  31.63 
 
 		 590 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  33.77 
 
 		 572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  33.77 
 
 		 619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  33.77 
 
 		 572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  30.93 
 
 		 571 aa  214  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1268  sulphate transporter  33.08 
 
 		 658 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0855544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  31.34 
 
 		 592 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  31.16 
 
 		 624 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  32.15 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.08 
 
 		 569 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.08 
 
 		 569 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  28.52 
 
 		 574 aa  207  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  30.81 
 
 		 575 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  30.82 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  30.24 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  28.29 
 
 		 565 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.85 
 
 		 596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  30.81 
 
 		 563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  29.73 
 
 		 573 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  31.39 
 
 		 590 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  29.49 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  32.6 
 
 		 559 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  28.78 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  29.49 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  29.49 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  28.62 
 
 		 578 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  30.73 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  28.4 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  30.02 
 
 		 605 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  29.28 
 
 		 570 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  31.46 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  29.65 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.6 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  29.1 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.14 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.14 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  30.14 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  29.28 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.14 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  30.14 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.14 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.14 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  29.98 
 
 		 585 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  28.7 
 
 		 586 aa  183  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  27.08 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  30.47 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  27.92 
 
 		 585 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  31.23 
 
 		 591 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  31.5 
 
 		 570 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  32.28 
 
 		 569 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.16 
 
 		 573 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  30.63 
 
 		 587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  29.19 
 
 		 573 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  31.61 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  27.42 
 
 		 592 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  28.6 
 
 		 569 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  30.67 
 
 		 558 aa  170  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  24.48 
 
 		 571 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  28.24 
 
 		 573 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  28.09 
 
 		 579 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  28.09 
 
 		 579 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  25.58 
 
 		 580 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  27.96 
 
 		 585 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  30.81 
 
 		 581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  26.51 
 
 		 584 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  27.73 
 
 		 565 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  29.01 
 
 		 605 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  24.3 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  28.19 
 
 		 567 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  26.6 
 
 		 608 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  28.11 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  26.73 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  28.25 
 
 		 576 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  28.17 
 
 		 585 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  28.82 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.16 
 
 		 550 aa  161  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  25.42 
 
 		 578 aa  160  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  29.79 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  27.96 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  27.31 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  27.32 
 
 		 588 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  27.31 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  27.31 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>