More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1041 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 563 aa  1091    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.5 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  46.95 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  46.95 
 
 		 539 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  46.95 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.22 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  45.42 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  46.36 
 
 		 503 aa  363  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.54 
 
 		 527 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  43.02 
 
 		 534 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.01 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.84 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.15 
 
 		 527 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.75 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.79 
 
 		 549 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.93 
 
 		 558 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  35.46 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.12 
 
 		 540 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.94 
 
 		 521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 529 aa  213  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.64 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 529 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.04 
 
 		 542 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.71 
 
 		 529 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  33.52 
 
 		 528 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  27.39 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  27.39 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  27.39 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  28.91 
 
 		 533 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  27.2 
 
 		 543 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.33 
 
 		 536 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  27.39 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  28.21 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  28.21 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.21 
 
 		 543 aa  187  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  28.21 
 
 		 543 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  28.21 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  28.21 
 
 		 543 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  32.84 
 
 		 534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  32.54 
 
 		 534 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.04 
 
 		 553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  29.57 
 
 		 542 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.94 
 
 		 527 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  27.99 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  32.25 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  32.54 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  32.25 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  28.99 
 
 		 542 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  27.61 
 
 		 538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.3 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.08 
 
 		 526 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  32.84 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  32.54 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  26.72 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  31.94 
 
 		 534 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  31.94 
 
 		 534 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.06 
 
 		 525 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.46 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.89 
 
 		 529 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1347  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.31 
 
 		 575 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638026 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  26.56 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  27.15 
 
 		 533 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.24 
 
 		 553 aa  171  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.86 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  26.65 
 
 		 536 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  26.26 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1304  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.76 
 
 		 591 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0304206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.11 
 
 		 540 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.25 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.87 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.87 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.43 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.86 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 516 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0784  sensor kinase DpiB  27.37 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636686  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0680  sensor kinase DpiB  27.19 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.520362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0666  sensor kinase DpiB  27.19 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.863518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0740  sensor kinase DpiB  27.19 
 
 		 553 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  30.65 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3025  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.67 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  27.67 
 
 		 552 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3006  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.67 
 
 		 552 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 569 aa  156  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  27.32 
 
 		 541 aa  156  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  27.67 
 
 		 552 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00589  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with citB  27.67 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  27.29 
 
 		 552 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  30.51 
 
 		 536 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>