More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5077 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
558 aa  1086    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.51 
 
 
583 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.22 
 
 
527 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.95 
 
 
556 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.4 
 
 
524 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.51 
 
 
529 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.97 
 
 
527 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  38.38 
 
 
520 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.83 
 
 
549 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.7 
 
 
563 aa  279  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.47 
 
 
553 aa  269  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.99 
 
 
558 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.4 
 
 
542 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.8 
 
 
538 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.7 
 
 
534 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  29.6 
 
 
536 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  30.59 
 
 
534 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.88 
 
 
540 aa  256  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  29.17 
 
 
533 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
534 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  29.23 
 
 
536 aa  252  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  28.96 
 
 
533 aa  251  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  29.23 
 
 
536 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  29.23 
 
 
536 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  29.91 
 
 
534 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  29.91 
 
 
534 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  29.1 
 
 
534 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  29.91 
 
 
534 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  30.46 
 
 
533 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  29.28 
 
 
528 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  30.13 
 
 
534 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  29.94 
 
 
534 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  29.54 
 
 
534 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.87 
 
 
539 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.87 
 
 
539 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  29.94 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.87 
 
 
539 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
536 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.42 
 
 
532 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  29.78 
 
 
534 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  29.31 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  29.16 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  29.31 
 
 
529 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  28.94 
 
 
529 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.76 
 
 
536 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  28.2 
 
 
529 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.16 
 
 
529 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  29.18 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.61 
 
 
569 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  29.8 
 
 
543 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1347  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.02 
 
 
575 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  29.3 
 
 
537 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  29.39 
 
 
538 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  29.62 
 
 
543 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  29.62 
 
 
543 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  29.62 
 
 
543 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.99 
 
 
543 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.88 
 
 
546 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.15 
 
 
527 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.28 
 
 
540 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  29.06 
 
 
543 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.24 
 
 
543 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  29.06 
 
 
543 aa  227  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  29.06 
 
 
543 aa  226  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  29.06 
 
 
543 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  29.44 
 
 
543 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  29.21 
 
 
543 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.06 
 
 
526 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.46 
 
 
529 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.09 
 
 
521 aa  225  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.93 
 
 
503 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  30 
 
 
537 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  28.88 
 
 
533 aa  223  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.88 
 
 
525 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.37 
 
 
553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.1 
 
 
525 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  29.96 
 
 
542 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.14 
 
 
532 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  29.73 
 
 
542 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.65 
 
 
537 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.61 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.84 
 
 
537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.97 
 
 
537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.61 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.65 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.89 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.65 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.65 
 
 
537 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1162  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.83 
 
 
528 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.308176  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.7 
 
 
545 aa  211  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0318  sensor kinase citA  27.71 
 
 
565 aa  210  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1304  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.87 
 
 
591 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0304206  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.93 
 
 
551 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.9 
 
 
519 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.52 
 
 
534 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  35.67 
 
 
536 aa  191  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  24.14 
 
 
516 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  24.7 
 
 
516 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>