22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2499 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2499  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.913757  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  83.33 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  53.7 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  54 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  54 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  54 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 		 331 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  49.02 
 
 		 317 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 434 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  46.51 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  46.51 
 
 		 318 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  53.7 
 
 		 331 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 318 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 276 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.18 
 
 		 338 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  47.92 
 
 		 323 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 329 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 322 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 333 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  41.07 
 
 		 478 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>