33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0023 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  100 
 
 		 75 aa  146  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  65 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  56.06 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  52.17 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  60.94 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  54.55 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  54.55 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  57.58 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  57.58 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  57.58 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  57.58 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.84 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.66 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.45 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.06 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  53.03 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  44.44 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.59 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.06 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.97 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  48.39 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  44.78 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  43.94 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  45.9 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.94 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2205  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  45.9 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  46.15 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61679  predicted protein  39.68 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90470  predicted protein  39.68 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.0000995977  normal  0.361708 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02426  Histone H4.2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P23751]  35.59 
 
 		 103 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000460167  normal  0.25015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>