25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0110 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  100 
 
 		 143 aa  274  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  81.12 
 
 		 143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2205  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  77.62 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  70.92 
 
 		 146 aa  170  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0564  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  75.89 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.646142  normal  0.2953 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  48.39 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  43.55 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  47.54 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.28 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.54 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  47.54 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.54 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.9 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.91 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  41.67 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  40.91 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.91 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.91 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  40.91 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  36.76 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.98 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.98 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  40.98 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.98 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04034  transcription factor HapC (Eurofung)  23.88 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.803241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>