29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0834 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  100 
 
 		 68 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  88.24 
 
 		 68 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  88.06 
 
 		 68 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  76.47 
 
 		 68 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  85.29 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  75.76 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  68.75 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  67.19 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  62.5 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  54.55 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  54.55 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.73 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.03 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  53.03 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  53.03 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.03 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.52 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  47.54 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  50 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.97 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.45 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  46.97 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  46.15 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  36.51 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  46.03 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  40.98 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  41.43 
 
 		 152 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>