30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1704 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  100 
 
 
74 aa  146  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.22 
 
 
67 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  58.06 
 
 
66 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  58.06 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  58.06 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  50.72 
 
 
86 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.23 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  55.93 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  47.76 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.76 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.76 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  47.76 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.23 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  43.66 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  44.78 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.97 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  45.16 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  47.54 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  41.18 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  39.71 
 
 
69 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.9 
 
 
68 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  43.28 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.77 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  43.55 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.55 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  38.24 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2205  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  38.24 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  45.16 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  38.71 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>