26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1432 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  100 
 
 
78 aa  156  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.38 
 
 
67 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  58.73 
 
 
66 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.38 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.38 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  55.38 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  55.38 
 
 
67 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  56.92 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  56.92 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  56.92 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.85 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  48.44 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  44.78 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  47.14 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  40 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  47.69 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  44.44 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  42.62 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  40.3 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.69 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  44.62 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  40 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.15 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.08 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.75 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  40 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>