27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0576 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  100 
 
 
69 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  85.51 
 
 
69 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  73.91 
 
 
69 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  67.16 
 
 
68 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  62.12 
 
 
68 aa  87.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  62.12 
 
 
68 aa  87  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  62.5 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  66.67 
 
 
68 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  57.81 
 
 
67 aa  73.9  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.52 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  53.12 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  53.12 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.12 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.56 
 
 
67 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.12 
 
 
67 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.12 
 
 
66 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  50 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  50 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.31 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  46.97 
 
 
73 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  49.21 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  47.06 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  40.3 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  39.71 
 
 
74 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  31.82 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  37.31 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>