31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1584 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1584  histone  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  66.67 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  65 
 
 		 75 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.12 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  55.74 
 
 		 66 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.74 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  55.74 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  57.38 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  57.38 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  50.77 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  53.12 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.12 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.12 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  53.12 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.93 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.54 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  49.21 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.54 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  52.46 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.54 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.62 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  42.62 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.03 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  46.03 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  42.62 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  44.26 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  43.55 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  42.42 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  40.98 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2205  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  39.34 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0564  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  39.06 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.646142  normal  0.2953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>