27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1071 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  100 
 
 
68 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  88.06 
 
 
68 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  83.58 
 
 
68 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  78.46 
 
 
68 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  80.6 
 
 
68 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  68.18 
 
 
69 aa  94  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  66.67 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  71.21 
 
 
67 aa  90.1  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  62.12 
 
 
69 aa  87.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.22 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  54.55 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  54.55 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.55 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.52 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.52 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  51.52 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  51.52 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  47.54 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  50 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  48.44 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  47.69 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.31 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.9 
 
 
74 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  43.94 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  37.1 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  43.94 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>