30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1305 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  100 
 
 
67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  82.09 
 
 
67 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  82.09 
 
 
67 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  82.09 
 
 
67 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  82.09 
 
 
67 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  75.76 
 
 
66 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  75.76 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  74.24 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  75.76 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  71.21 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  55.22 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  53.12 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  56.25 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  56.06 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1432  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  55.38 
 
 
78 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  53.73 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  57.81 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.56 
 
 
69 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.69 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0834  transcription factor CBF/NF-Y histone  53.03 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.687128  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0494  histone  57.58 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.957808  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  47.62 
 
 
86 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  50 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2458  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.56 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  54.69 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1071  transcription factor CBF/NF-Y histone  51.52 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  43.28 
 
 
143 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  40.91 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2205  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  43.28 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  43.28 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>