26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0416 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0416  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  100 
 
 
143 aa  280  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2205  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  90.21 
 
 
143 aa  251  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0110  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  81.12 
 
 
143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.835787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2248  Histone core domain protein  68.79 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.771026  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0564  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  77.3 
 
 
145 aa  165  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.646142  normal  0.2953 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0231  histone  50 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1326  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  50 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0950819  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0592  transcription factor CBF/NF-Y histone  50 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0853808  normal  0.113464 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0658  transcription factor CBF/NF-Y histone  48.39 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0659  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.08 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000216135  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1305  transcription factor CBF/NF-Y histone  43.28 
 
 
67 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.905778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1584  histone  40.98 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0023  transcription factor  45.9 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1704  transcription factor CBF/NF-Y histone  38.24 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.356758  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1252  histone  41.79 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1373  transcription factor CBF/NF-Y histone  41.79 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.295317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1921  transcription factor CBF/NF-Y histone  41.67 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1384  transcription factor CBF/NF-Y histone  41.79 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0524  transcription factor CBF/NF-Y/histone domain-containing protein  41.79 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1375  histone  37.31 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0348  transcription factor CBF/NF-Y histone  39.13 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0365  transcription factor CBF/NF-Y histone  42.62 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204552  normal  0.073064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1748  Transcription factor CBF/NF-Y/histone domain protein  42.62 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0919  transcription factor CBF/NF-Y histone  45.9 
 
 
68 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766751  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0576  transcription factor CBF/NF-Y histone  37.31 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0168926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0165  transcription factor CBF/NF-Y histone  39.34 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>