95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3187 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3187  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  100 
 
 		 309 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.632507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3156  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  57.14 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2045  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  58.89 
 
 		 289 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1164  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  60.89 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1457  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  60.89 
 
 		 452 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1152  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  60.15 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4291  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  62.5 
 
 		 278 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1274  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  59.41 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0492146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0793  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  59.41 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1246  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  59.04 
 
 		 288 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4417  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  60.31 
 
 		 288 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1487  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  57.48 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0609  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  62.03 
 
 		 705 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1261  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  62.03 
 
 		 714 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1589  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  57.48 
 
 		 426 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3032  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  62.03 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0544  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  62.03 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0029  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  60 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  60 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2798  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  61.07 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0351  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  54.86 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0051  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  59.11 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal  0.107341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6852  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  56.87 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  45.69 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0666841  normal  0.0740235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0789  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  55.4 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000225089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4015  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  47.35 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1076  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  48.29 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1848  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  45.39 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351206  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1141  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  34.57 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0392227  normal  0.36421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1763  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  43.32 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0074  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  46.44 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5369  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  46.4 
 
 		 287 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1757  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  39.54 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0328  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.05 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2317  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  40.75 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  38.73 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.53 
 
 		 467 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10290  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40.73 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00426102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3658  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.55 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3370  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.57 
 
 		 281 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  41.57 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5086  2-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephosphocoenzyme- A synthase  36.24 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2882  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40.45 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4592  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.2 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2439  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40.3 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.045617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1319  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.95 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4926  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  39.29 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0701  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.46 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0632  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.69 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0947  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  41.48 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.908595  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3012  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  38.08 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00570  hypothetical protein  38.08 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0527  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.61 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2405  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.83 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3031  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.08 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00581  triphosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.08 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0635  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.08 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.474806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0664  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.08 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.31 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0443  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.86 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  44.59 
 
 		 235 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.467581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4820  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40.65 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479004  normal  0.0163783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1845  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40.14 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3166  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.47 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0070  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.32 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.32 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0067  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.32 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0069  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.32 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.32 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0719  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.57 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.647877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2497  hypothetical protein  31.88 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02560  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40.6 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0205763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5301  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  39.45 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206727  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1246  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  36.58 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0659  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.69 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0732  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.69 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0673  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.69 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4940  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.08 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0941184 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3864  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.08 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5086  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.68 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  0.0919375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0293  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3301  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.35 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1161  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.32 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0451951  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0425  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.37 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0595  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.31 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1054  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2611  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  35.71 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3856  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.47 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.78 
 
 		 233 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0451  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.06 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3941  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.94 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239715 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1523  citXG protein, putative  27 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0190  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.37 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0806  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  28.16 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0172  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.37 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000510729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>