90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0190 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0190  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0172  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  98.13 
 
 		 267 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000510729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3856  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  60 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3941  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  60 
 
 		 272 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0451  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  48.37 
 
 		 339 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0806  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  44.71 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  30.18 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10290  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.87 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00426102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1757  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  29.89 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2882  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.6 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4417  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.95 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3658  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.84 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0074  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  31.89 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1246  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  29.26 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4592  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.74 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2045  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  30 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0793  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.48 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1152  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.7 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1274  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.48 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0492146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3370  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1763  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.25 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1164  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  32.58 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2611  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  31.82 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5369  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.2 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1076  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  32.53 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4015  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.89 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0328  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  30.17 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0425  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.35 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0070  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  30.36 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4940  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.09 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0941184 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3864  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.09 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5086  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.56 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  0.0919375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  30.88 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2497  hypothetical protein  25.74 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0069  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  29.46 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  29.46 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2317  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  29.75 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0067  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  29.46 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  29.46 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2439  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.14 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.045617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0351  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  32.88 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3156  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  30.65 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5086  2-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephosphocoenzyme- A synthase  30.88 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3166  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  26.64 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0293  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.48 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1848  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.42 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5301  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.91 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206727  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4820  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.65 
 
 		 307 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479004  normal  0.0163783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1246  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  30.88 
 
 		 284 aa  62  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1161  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.32 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0451951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4291  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.73 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02560  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.44 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0205763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0789  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.86 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000225089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.95 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2405  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  28.72 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4926  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.62 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1845  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.36 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0443  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.72 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0029  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  32.53 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1457  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  29.89 
 
 		 452 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  34 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.32 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.467581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  26.85 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3187  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  28.85 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.632507 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3032  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.83 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0544  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  30.83 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1261  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.83 
 
 		 714 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0609  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.83 
 
 		 705 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0719  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  26.52 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.647877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2798  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  31 
 
 		 330 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1589  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.45 
 
 		 426 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1487  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.45 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.47 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0051  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  32.26 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal  0.107341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00570  hypothetical protein  25.45 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3012  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  25.45 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139818  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3031  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.45 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0664  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.45 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00581  triphosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  25.45 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0635  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.45 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.474806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0632  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.82 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0701  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.38 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0527  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  25.18 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  40 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0666841  normal  0.0740235 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0595  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.56 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0659  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  27.83 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0732  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  27.83 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0673  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  27.83 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0947  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  30.14 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.908595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6852  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  31.17 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>