93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3301 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3301  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  100 
 
 		 320 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1054  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  80.87 
 
 		 300 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1319  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  58.33 
 
 		 307 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0328  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  35.66 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  39.77 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04700  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.56 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1757  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  38.4 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  38.01 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2317  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  37.69 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3166  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.08 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2405  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  38.6 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146985  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0070  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  35.91 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  35.91 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0067  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  35.91 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0069  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  35.91 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0068  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  35.91 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1161  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.69 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0451951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.99 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.843042  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0595  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.36 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0719  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.64 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.647877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3370  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  37.25 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10290  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.33 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00426102  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0425  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.27 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0673  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.99 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2882  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.25 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0659  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.99 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1141  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  28.06 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0392227  normal  0.36421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0732  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.99 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3658  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.09 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0632  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3156  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  37.72 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00581  triphosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.75 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0635  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.474806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0664  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3031  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00570  hypothetical protein  34.75 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3012  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG  34.75 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.139818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0701  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0527  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.36 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5301  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.33 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206727  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4926  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.22 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1246  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  36.84 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0030  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  36.75 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1274  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.26 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0492146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0793  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.26 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2439  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.87 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.045617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4592  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.84 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4417  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.09 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0051  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  39.58 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.32958  normal  0.107341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3187  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  34.35 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.632507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0443  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.73 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0029  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  35.64 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1152  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.43 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.536064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5086  2-(5''-triphosphoribosyl)-3'-dephosphocoenzyme- A synthase  32.13 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1076  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  31.72 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1164  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  35.96 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4015  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  34.93 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2045  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  36.84 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1763  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.72 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0947  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.44 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.908595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1848  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.63 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1845  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.21 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0074  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  32.4 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6852  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  36.05 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1457  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  35.59 
 
 		 452 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3864  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.07 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.516158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4940  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.07 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0941184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0789  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.14 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000225089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5086  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.27 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  0.0919375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4291  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  36.92 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2798  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  36.13 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0351  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  33.58 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4820  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.22 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479004  normal  0.0163783 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0544  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  35.11 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3032  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.11 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0609  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.11 
 
 		 705 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1261  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  35.11 
 
 		 714 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1487  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 431 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1589  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.75 
 
 		 426 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1246  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  29.41 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5369  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.4 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02560  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.58 
 
 		 293 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0205763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0293  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.58 
 
 		 293 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2611  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  30.94 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3778  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  29.18 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3856  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.6 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1523  citXG protein, putative  25.37 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3941  Triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  31.03 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000239715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  32.68 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.467581  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2497  hypothetical protein  23.95 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  33.65 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0666841  normal  0.0740235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0451  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.12 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0806  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  25.97 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>