34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0338 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  62.1 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  62.12 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  62.9 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  63.28 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  49.18 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  49.19 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  47.15 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  41.94 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  41.13 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  43.7 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  46.15 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  45.3 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  46.02 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  42.48 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  35.2 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  42.54 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  40.32 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  41.41 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  35.2 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  35.2 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  38.52 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  37.7 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  40.62 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  38.74 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  33.11 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  36.44 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  35.25 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2296  hypothetical protein  59.46 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  31.58 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  32.97 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  35 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase 2  36.17 
 
 		 410 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00109024  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  34.74 
 
 		 237 aa  41.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>