33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1465 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  96.77 
 
 		 124 aa  243  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  94.35 
 
 		 124 aa  239  7e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  78.63 
 
 		 118 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  71.05 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  53.39 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  52.21 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  49.57 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  48.21 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  44.44 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  50.89 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  45.3 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  47.66 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  43.59 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  37.3 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  39.82 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  40.54 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  35.4 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  48.35 
 
 		 214 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  39.32 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  45.22 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  44.35 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  42.61 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  41.74 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  41.74 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  40 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  39.13 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  45.92 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  35.05 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  33.33 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  31.13 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  33.98 
 
 		 237 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7099  predicted protein  29.52 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.360457  normal  0.295389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>