32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1388 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  60.28 
 
 		 212 aa  234  9e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  56 
 
 		 131 aa  108  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 		 118 aa  90.9  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  47.12 
 
 		 150 aa  89.4  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  47.12 
 
 		 148 aa  88.2  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  44.86 
 
 		 124 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  49.45 
 
 		 124 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  45.92 
 
 		 137 aa  86.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  48.08 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  48.35 
 
 		 124 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 		 122 aa  85.9  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  46.53 
 
 		 129 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  44.23 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  41 
 
 		 132 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  44 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  43.27 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  44.21 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  42 
 
 		 139 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  46.24 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  39.39 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  42 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  41.67 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  40.62 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  36.63 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  49.23 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  37.37 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  35 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  30.3 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  32.32 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  36.36 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  30.69 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>