31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02780 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  64.71 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  68.78 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  52.94 
 
 		 245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7099  predicted protein  50 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.360457  normal  0.295389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  40.5 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  37.19 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  35.54 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  31.97 
 
 		 130 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  38.38 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  30.89 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  31.71 
 
 		 124 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  30.25 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  33.59 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  31.13 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  33.61 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  29.84 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  30.65 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  33.65 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  36.79 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  33.87 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  31.78 
 
 		 148 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  30.77 
 
 		 118 aa  52.4  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  35.71 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  36.36 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  36.25 
 
 		 135 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  42.59 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  35 
 
 		 132 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  30.7 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  29.06 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  27.13 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>