34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0462 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 		 132 aa  263  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  62.1 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  55.38 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  62.12 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  60.61 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  50.39 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  48.76 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  45.59 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  41.41 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  47.62 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  47.37 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  46.22 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  39.68 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  44.44 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  43.31 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  44.44 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  37.69 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  38.58 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  41.53 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  42.73 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  40.3 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  39.86 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  42.37 
 
 		 148 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  41.53 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  41 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  38.98 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  40.5 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  40.66 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  37.61 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  42.86 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7099  predicted protein  32.17 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.360457  normal  0.295389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2296  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>