33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0802 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  100 
 
 
129 aa  258  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  50.39 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  48.39 
 
 
132 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 
139 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  53.39 
 
 
124 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  52.85 
 
 
131 aa  130  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  53.39 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  53.85 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  54.17 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  49.22 
 
 
135 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  47.54 
 
 
143 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  48.25 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  50 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  49.21 
 
 
137 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  50.82 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  39.06 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  51.35 
 
 
131 aa  107  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  39.68 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  43.08 
 
 
134 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  42.97 
 
 
134 aa  104  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  44.92 
 
 
150 aa  96.7  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  45.76 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  44.53 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  42.34 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  43.22 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  46.53 
 
 
214 aa  84.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  46.08 
 
 
212 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  40.4 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  45.16 
 
 
236 aa  70.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  38.38 
 
 
237 aa  61.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  38.95 
 
 
237 aa  50.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7099  predicted protein  34.45 
 
 
236 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.360457  normal  0.295389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>