69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0163 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0163  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
226 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1596  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  69.74 
 
 
229 aa  328  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.6 
 
 
237 aa  272  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.22 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.77 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000311269  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.66 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3247  iron-sulfur cluster-binding protein  37.75 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3185  Iron-sulfur cluster-binding protein  37.6 
 
 
237 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000998162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.4 
 
 
269 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1702  ferredoxin  40.49 
 
 
240 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0035  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.75 
 
 
234 aa  154  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000757176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.94 
 
 
241 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000282709  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0902  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.21 
 
 
314 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.533273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3448  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.4 
 
 
250 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
249 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00451529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3017  hypothetical protein  47.65 
 
 
152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.941348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 
242 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.568616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1233  hypothetical protein  46.98 
 
 
152 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000690186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.77 
 
 
251 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50 
 
 
277 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232825  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.57 
 
 
263 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05575  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2660  hypothetical protein  49.32 
 
 
151 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2649  hypothetical protein  50.7 
 
 
151 aa  141  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.22 
 
 
250 aa  141  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.26 
 
 
283 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.58 
 
 
272 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000371436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0339  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.01 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.101668  normal  0.562339 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05970  4Fe-4S protein  38.59 
 
 
240 aa  134  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.526653 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.84 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.68 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.98127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1749  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.1 
 
 
242 aa  133  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.46 
 
 
236 aa  132  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000519227  hitchhiker  0.00000000000000416733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.03 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0429552  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1492  iron-sulfur cluster-binding protein  43.54 
 
 
291 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00658416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0220  hypothetical protein  46 
 
 
151 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0442149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.58 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0770  hypothetical protein  43.23 
 
 
151 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.790438  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1671  iron-sulfur cluster-binding protein  32.58 
 
 
284 aa  128  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.450491  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3949  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.94 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2642  iron-sulfur cluster-binding protein  34.98 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.13 
 
 
293 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.48 
 
 
240 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00390588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.21 
 
 
297 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0181618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1980  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.22 
 
 
300 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167299  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0504  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.46 
 
 
285 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.720822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 
284 aa  121  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4082  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.66 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08160  4Fe-4S protein  43.31 
 
 
322 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.127337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0703  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.03 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.76 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.67 
 
 
297 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000287541  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.28 
 
 
1481 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  41.94 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1890  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.76 
 
 
124 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2752  glycyl-radical activating family protein  43.1 
 
 
310 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  52.94 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  25.56 
 
 
275 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0471  NADH dehydrogenase (quinone)  40.32 
 
 
620 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000177124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.62 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
296 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2152  molybdopterin oxidoreductase  37.68 
 
 
880 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  25.93 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.16 
 
 
131 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.96 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000823562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0570  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  39.68 
 
 
87 aa  42  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  23.61 
 
 
274 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
147 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
632 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>