52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0770 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0770  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  313  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.790438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3017  hypothetical protein  82.24 
 
 		 152 aa  265  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.941348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2660  hypothetical protein  78.15 
 
 		 151 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1233  hypothetical protein  80.92 
 
 		 152 aa  258  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000690186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0220  hypothetical protein  70.2 
 
 		 151 aa  235  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0442149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2649  hypothetical protein  65.56 
 
 		 151 aa  226  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  53.21 
 
 		 258 aa  168  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3247  iron-sulfur cluster-binding protein  54.55 
 
 		 243 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.33 
 
 		 242 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3185  Iron-sulfur cluster-binding protein  51.7 
 
 		 237 aa  160  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000998162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3949  hypothetical protein  49.32 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4231  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.67 
 
 		 273 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.39 
 
 		 241 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000282709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.95 
 
 		 249 aa  151  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00451529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.01 
 
 		 273 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.31 
 
 		 277 aa  150  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232825  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.95 
 
 		 242 aa  150  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.568616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0035  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.65 
 
 		 234 aa  149  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000757176  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0504  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.32 
 
 		 285 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1492  iron-sulfur cluster-binding protein  48.61 
 
 		 291 aa  149  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00658416  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.37 
 
 		 293 aa  148  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.32 
 
 		 283 aa  148  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0307  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.95 
 
 		 251 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  49.33 
 
 		 297 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0181618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.62 
 
 		 284 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1980  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.32 
 
 		 300 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.55 
 
 		 272 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000371436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0902  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.03 
 
 		 314 aa  144  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.533273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1702  ferredoxin  46.9 
 
 		 240 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4082  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  48.65 
 
 		 269 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.79 
 
 		 242 aa  140  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000311269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0339  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.29 
 
 		 265 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.101668  normal  0.562339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3448  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 250 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2454  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.92 
 
 		 271 aa  138  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1749  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.67 
 
 		 242 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.87 
 
 		 250 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0163  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.23 
 
 		 226 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.66 
 
 		 269 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.48 
 
 		 238 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.98127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.92 
 
 		 263 aa  131  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05575  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.28 
 
 		 237 aa  130  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425007  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1596  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.76 
 
 		 229 aa  128  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08160  4Fe-4S protein  47.9 
 
 		 322 aa  127  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.127337 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.58 
 
 		 236 aa  126  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000519227  hitchhiker  0.00000000000000416733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05970  4Fe-4S protein  43.36 
 
 		 240 aa  125  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.526653 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.14 
 
 		 249 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0429552  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.03 
 
 		 240 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00390588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1671  iron-sulfur cluster-binding protein  47.73 
 
 		 284 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.450491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.26 
 
 		 297 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000287541  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.43 
 
 		 293 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580044 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2642  iron-sulfur cluster-binding protein  39.31 
 
 		 253 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0703  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 271 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.144882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>